این کارگاه تخصصی، شما را با اصول و تکنیک‌های پیشرفته آنالیز داده‌های متاژنوم آشنا می‌سازد. در این دوره، شما با پیش‌پردازش اولیه توالی‌ها و استخراج اطلاعات، مپینگ توالی برای شناسایی میکروارگانیسم‌ها و فراوانی آن‌ها، روش‌های مبتنی بر مپینگ، روش‌های مبتنی بر اسمبلی و حاشیه‌نویسی توالی‌های ژنی با استفاده از پایگاه داده KEGG آشنا خواهید شد. این مهارت‌ها برای فعالیت در زمینه‌های مختلف میکروبیوم، بیوانفورماتیک و تحقیقات میکروبی ضروری هستند.

مهارت‌های اکتسابی در کارگاه آنالیز داده های متاژنوم:

• توانایی Initial preprocessing on sequences and extracting information about them (پیش‌پردازش اولیه توالی‌ها و استخراج اطلاعات)
• تسلط بر Sequence mapping to obtain microorganisms present in samples and their abundance (مپینگ توالی برای شناسایی میکروارگانیسم‌ها و فراوانی آن‌ها)
• آشنایی با Mapping-Based Methods (روش‌های مبتنی بر مپینگ)
• مهارت در Assembly-Based Methods (روش‌های مبتنی بر اسمبلی)
• توانایی Annotating Gene Sequences Using the KEGG Database and Obtaining this Information (حاشیه‌نویسی توالی‌های ژنی با استفاده از پایگاه داده KEGG و استخراج اطلاعات)

کاربردهای تخصصی آنالیز داده‌های متاژنوم:

• مطالعات میکروبیوم انسانی: شناسایی جامعه میکروبی روده، پوست و سایر نقاط بدن
• تحقیقات محیطی: آنالیز میکروبیوم خاک، آب و هوا
• صنایع غذایی: بررسی میکروبیوم محصولات غذایی و فرآیندهای تخمیر
• پزشکی شخصی‌شده: ارتباط میکروبیوم با بیماری‌ها و پاسخ به درمان
• اکتشاف آنزیم‌های جدید: شناسایی ژن‌های کدکننده آنزیم‌های صنعتی

نیاز بازار کار و فرصت‌های شغلی آنالیز داده های متاژنوم

در سطح بین‌الملل:

تسلط بر آنالیز داده‌های متاژنوم، یک مهارت بسیار پرتقاضا در شرکت‌های بیوتکنولوژی، مؤسسات تحقیقاتی و مراکز دانشگاهی در سراسر جهان است. موقعیت‌های شغلی مانند Metagenomics Analyst، Microbiome Researcher و Bioinformatics Scientist از جمله فرصت‌های شغلی این حوزه هستند.

در داخل ایران:

با گسترش مطالعات میکروبیوم و افزایش توجه به نقش میکروارگانیسم‌ها در سلامت و محیط زیست، تقاضا برای متخصصان آنالیز متاژنوم در ایران در حال رشد است. این تخصص امکان اشتغال در مراکز تحقیقاتی، شرکت‌های دانش‌بنیان و آزمایشگاه‌های تخصصی را فراهم می‌کند.

آینده شغلی آنالیز داده های متاژنوم در ایران:

با سرمایه‌گذاری در حوزه میکروبیوم و پزشکی شخصی‌شده، آینده این حرفه در ایران بسیار امیدوارکننده است. یک متخصص می‌تواند در مسیر مدیریت پروژه‌های متاژنومیکس، توسعه الگوریتم‌های تحلیل داده و مشاوره تخصصی پیشرفت کند.

آینده شغلی آنالیز داده های متاژنوم در خارج از ایران:

توسعه فناوری‌های نوین در زمینه single-cell metagenomics، long-read sequencing و یکپارچه‌سازی داده‌های چند omics، زمینه‌های جدیدی برای پژوهش و اشتغال ایجاد کرده است. یک متخصص می‌تواند در شرکت‌های پیشرو در زمینه پزشکی میکروبیوم فعالیت نماید.

نکات جالب و کاربردی:

• متاژنومیکس امکان مطالعه میکروارگانیسم‌های غیرقابل کشت را فراهم می‌کند
• ابزارهایی مانند Kraken و MetaPhlAn برای طبقه‌بندی تاکسونومیکی استفاده می‌شوند
• پایگاه داده KEGG اطلاعات ارزشمندی درباره مسیرهای متابولیک ارائه می‌دهد
• روش‌های مبتنی بر اسمبلی مانند MEGAHIT امکان بازسازی ژنوم‌های میکروبی را فراهم می‌کنند
• داده‌های متاژنوم می‌توانند اطلاعاتی درباره عملکرد جامعه میکروبی ارائه دهند

سرفصل‌های اصلی کارگاه آینده شغلی آنالیز داده های متاژنوم:

1. Initial preprocessing on sequences and extracting information about them: آموزش کنترل کیفیت، فیلتر کردن و trimming توالی‌ها
2. Sequence mapping to obtain microorganisms present in samples and their abundance: تسلط بر آنالیز تاکسونومیکی و محاسبه فراوانی
3. Mapping-Based Methods: آشنایی با ابزارهای مپینگ و آنالیز مبتنی بر مرجع
4. Assembly-Based Methods: آموزش اسمبلی د نوو و بازسازی ژنوم
5. Annotating Gene Sequences Using the KEGG Database and Obtaining this Information: تسلط بر حاشیه‌نویسی عملکردی و آنالیز مسیرهای متابولیک

این کارگاه، شما را با دانش و مهارت‌های تخصصی لازم برای آنالیز داده‌های متاژنوم مجهز می‌کند و فرصت‌های شغلی متعددی در زمینه میکروبیوم و بیوانفورماتیک برای شما ایجاد خواهد کرد.