این کارگاه تخصصی، شما را با اصول و تکنیک‌های تحلیل داده‌های ترنسکریپتوم با استفاده از نرم افزار R آشنا می‌سازد. در این دوره، شما با مقدمه‌ای بر R و RStudio، روش‌های دانلود داده‌های RNA-seq از پایگاه‌های داده، ساختار داده‌های بیان ژن، آنالیز بیان تفاوتی ژن‌ها و روش‌های خروجی‌گیری نتایج آشنا خواهید شد. این مهارت‌ها برای فعالیت در زمینه‌های مختلف بیوانفورماتیک، ژنومیکس و تحقیقات ترنسکریپتوم ضروری هستند.

مهارت‌های اکتسابی در کارگاه آنالیز داده های ترنسکریپتوم در نرم افزار R:

• آشنایی با Brief Introduction to R and RStudio (مقدمه‌ای بر R و RStudio)
• توانایی Downloading RNA-seq Data from Database (دانلود داده‌های RNA-seq از پایگاه داده)
• درک Data Structure of Gene Expression (ساختار داده‌های بیان ژن)
• تسلط بر Differential Gene Expression Analysis (آنالیز بیان تفاوتی ژن)
• مهارت در Exporting Results (خروجی‌گیری نتایج)

کاربردهای تخصصی آنالیز ترنسکریپتوم:

• تحقیقات سرطان: شناسایی ژن‌های differentially expressed در تومورها
• مطالعات بیماری‌های ژنتیکی: کشف مسیرهای سیگنالینگ مرتبط با بیماری
• پژوهش‌های تکاملی: مقایسه پروفایل‌های بیان ژن بین گونه‌های مختلف
• داروسازی: شناسایی اهداف دارویی جدید بر اساس بیان ژن
• بیوتکنولوژی: بهینه‌سازی فرآیندهای تولید با آنالیز ترنسکریپتوم

نیاز بازار کار و فرصت‌های شغلی آنالیز داده های ترنسکریپتوم

در سطح بین‌الملل:

تسلط بر آنالیز داده‌های ترنسکریپتوم با R، یک مهارت بسیار پرتقاضا در شرکت‌های بیوتکنولوژی، مراکز تحقیقاتی و مؤسسات دانشگاهی در سراسر جهان است. موقعیت‌های شغلی مانند Bioinformatician، Computational Biologist و RNA-seq Data Analyst از جمله فرصت‌های شغلی این حوزه هستند.

در داخل ایران:

با توسعه پروژه‌های ژنومیکس و ترنسکریپتومیکس در ایران، تقاضا برای متخصصان تحلیل داده‌های RNA-seq در حال رشد است. این تخصص امکان اشتغال در مراکز تحقیقاتی، شرکت‌های دانش‌بنیان و آزمایشگاه‌های ژنتیک را فراهم می‌کند.

آینده شغلی آنالیز داده های ترنسکریپتوم در ایران:

با سرمایه‌گذاری در حوزه ژنومیکس و پزشکی شخصی‌شده، آینده این حرفه در ایران بسیار امیدوارکننده است. یک متخصص می‌تواند در مسیر مدیریت پروژه‌های ترنسکریپتومیکس، توسعه الگوریتم‌های تحلیل داده و مشاوره تخصصی پیشرفت کند.

آینده شغلی آنالیز داده های ترنسکریپتوم در خارج از ایران:

توسعه فناوری‌های نوین در زمینه single-cell RNA-seq، spatial transcriptomics و интеграومیکس، زمینه‌های جدیدی برای پژوهش و اشتغال ایجاد کرده است. یک متخصص می‌تواند در شرکت‌های پیشرو در زمینه تحلیل داده‌های omics فعالیت نماید.

نکات جالب و کاربردی:

• نرم‌افزار R یک محیط رایگان و open-source برای تحلیل‌های آماری و بیوانفورماتیک است
• بسته‌های بیوانفورماتیکی مانند DESeq2 و edgeR برای آنالیز بیان تفاوتی ژن استفاده می‌شوند
• داده‌های RNA-seq می‌توانند از پایگاه‌هایی مانند GEO و TCGA دانلود شوند
• آنالیز بیان تفاوتی ژن می‌تواند ژن‌های کلیدی درگیر در بیماری‌ها را شناسایی کند
• خروجی‌گیری نتایج شامل ایجاد heatmaps، volcano plots و enrichment analysis می‌شود

سرفصل‌های اصلی کارگاه آنالیز داده های ترنسکریپتوم در نرم افزار R:

1. Brief Introduction to R and RStudio: آشنایی با محیط R، دستورات پایه و مدیریت بسته‌ها
2. Downloading RNA-seq Data from Database: آموزش دانلود داده از GEO، SRA و سایر پایگاه‌ها
3. Data Structure of Gene Expression: درک ساختار داده‌های count matrix و metadata
4. Differential Gene Expression Analysis: تسلط بر آنالیز با DESeq2 و تفسیر نتایج
5. Exporting Results: آموزش خروجی‌گیری جداول، نمودارها و گزارش‌های تحلیلی

این کارگاه، شما را با دانش و مهارت‌های تخصصی لازم برای تحلیل داده‌های ترنسکریپتوم با R مجهز می‌کند و فرصت‌های شغلی متعددی در زمینه بیوانفورماتیک و ژنومیکس برای شما ایجاد خواهد کرد.