آزمایشگاه تحقیقاتی داروین علوم زیستی، جانوری، گیاهی و سلولهای بنیادی
کیت ترانس کریپتاز معکوس (cDNA Synthesis)
کیت cDNA Synthesis (ترانس کریپتاز معکوس) ابزاری استاندارد و ضروری در آزمایشگاه های زیست مولکولی برای تبدیل RNA به DNA مکمل (cDNA) است، که نقش کلیدی در تحلیل های ژن بیان، RT‑PCR و RT‑qPCR دارد. در این کیت ها، آنزیم Reverse Transcriptase (ترانس کریپتاز معکوس) به همراه ترکیبی از پرایمرها (مانند Oligo(dT) و Random Hexamers) و بافرهای بهینه شده، مولکول های RNA را به رشته ی cDNA تبدیل می کنند که سپس می تواند به عنوان الگو در واکنش های پایین دستی مورد استفاده قرار گیرد. استفاده از این کیت ها به پژوهشگران امکان می دهد تا از RNA های کم غلظت و حتی ساختارهای پیچیده یا با ثبات ثانویه بالا با بازده و صحت مناسب cDNA تهیه کنند. بسیاری از کیت های cDNA synthesis شامل بازدارنده های RNase هستند تا از تخریب RNA در طول واکنش جلوگیری شود و بافرهای خاصی برای بهبود بازده سنتز طراحی شده اند. محصول نهایی معمولاً cDNA تک رشته ای است که می تواند برای سنجش بیان ژن، کلونینگ، ساخت آرشیو cDNA و مطالعات توالی یابی مورد استفاده قرار گیرد، و بسته به نوع و برند کیت، قادر به سنتز cDNA از RNA در بازه های وسیع ورودی (کم تا بیش از چند میکروگرم) است.
کاربردهای کیت ترانس کریپتاز معکوس (cDNA Synthesis)
- سنتز cDNA از RNA کل یا mRNA برای تحلیل های RT‑PCR و RT‑qPCR
- آماده سازی الگو برای کلونینگ یا ساخت کتابخانه های cDNA
- تحقیقات بیان ژن و سنجش تغییرات بیان تحت شرایط آزمایشی
- آرشیوسازی و نگهداری اطلاعات ژنی به صورت cDNA برای مطالعات طولانی مدت
- کاربردهای مولکولی پیشرفته مانند توالی یابی و تحلیل های ساختاری
مشخصات فنی معمول کیت ترانس کریپتاز معکوس (cDNA Synthesis)
- نوع تکنیک: Reverse Transcription (سنتز cDNA)
- آنزیم اصلی: Reverse Transcriptase با فعالیت کم RNase‑H و پایداری حرارتی
- پرایمرها: Oligo(dT) و Random Hexamer برای پوشش کامل RNA
- واحد واکنش: معمولاً 10–20 µL بر اساس دستورالعمل کیت
- محدوده ورودی RNA: از pg تا چند µg (وابسته به نوع RNA و کیت)
- شرایط نگهداری: در دمای -20°C برای حفظ پایداری آنزیم ها و اجزا
- محدوده محصول: cDNA رشته اول مناسب برای PCR، qPCR، کلونینگ و سایر روش ها
پروتکل عملی (نحوه استفاده) کیت ترانس کریپتاز معکوس (cDNA Synthesis)
مرحله های استاندارد استفاده از کیت cDNA Synthesis:
- ۱. آماده سازی: همه معرف ها را روی یخ قرار دهید و RNA خالص و بدون آلودگی RNase آماده داشته باشید.
- ۲. افزودن پرایمرها: RNA نمونه را با پرایمرهای مناسب (مثلاً Oligo(dT) و/یا Random Hexamer) مخلوط کنید تا برای آغاز واکنش آماده شوند.
- ۳. مخلوط واکنش: اجزا مانند بافر، dNTPs، RT Enzyme و بازدارنده RNase را طبق دستورالعمل کیت اضافه کنید.
- ۴. برنامه ترمال: واکنش RT را در حرارت مناسب (معمولاً بین 42–55°C) برای مدت زمان توصیه شده اجرا کنید تا cDNA سنتز شود.
- ۵. تکمیل واکنش: پس از اتمام، آنزیم RT را با یک مرحله حرارتی کوتاه غیرفعال کنید (در صورت نیاز) تا آماده ی پایین دستی شود.
- ۶. استفاده از cDNA: cDNA حاصل را می توان مستقیماً به عنوان الگو در واکنش های PCR، qPCR و کلونینگ استفاده کرد.
مزایا و نکات کلیدی کیت ترانس کریپتاز معکوس (cDNA Synthesis)
- تبدیل کارآمد RNA به cDNA: بازده بالای سنتز حتی با RNA کم غلظت
- پشتیبانی از RNA با ساختار پیچیده یا GC‑غنی به دلیل آنزیم های با پایداری بالا
- استفاده از پرایمرهای ترکیبی برای پوشش کامل ترانسکریپت ها
- قابل استفاده در طیف گسترده ای از برنامه های RT‑PCR و RT‑qPCR
- اجتناب از آلودگی RNase با استفاده از RNase Inhibitor
نکات کاربردی آزمایشگاهی کیت ترانس کریپتاز معکوس (cDNA Synthesis)
- از RNA با خلوص بالا استفاده کنید تا بهترین بازده cDNA حاصل شود.
- واحدهای مناسب پرایمر را انتخاب کنید تا از ایجاد محصولات غیر خاص جلوگیری شود.
- محیط واکنش را از آلودگی RNase محافظت کنید (استفاده از لوازم RNase‑free توصیه می شود).
- پس از پایان سنتز، cDNA را می توان ذخیره یا برای واکنش های پایین دستی مورد استفاده قرار داد.
