آزمایشگاه تحقیقاتی داروین علوم زیستی، جانوری، گیاهی و سلولهای بنیادی
دوره کارآموزی بین المللی بیوانفورماتیک سرطان
اطلاعات دوره کارآموزی بین المللی بیوانفورماتیک سرطان
دوره کارآموزی بیوانفورماتیک سرطان
این دوره تخصصی و کاملاً حضوری، با هدف تربیت متخصصان کارآزموده در زمینه بیوانفورماتیک سرطان و داروسازی فردمحور طراحی شده است. شرکتکنندگان در محیطی پیشرفته و تحت نظارت اساتید مجرب، مهارتهای برنامهنویسی و تحلیلی مورد نیاز برای پردازش دادههای NGS در حوزه سرطان را فرا خواهند گرفت.
محورهای آموزشی این دوره:
آشنایی با الگوریتم های برنامه نویسی بیوانفورماتیکی سازه های ژنتیکی در داروسازی
آموزش الگوریتمهای تخصصی برای تحلیل دادههای ژنتیکی در داروسازی:
- الگوریتمهای همترازی توالی (Sequence Alignment) برای شناسایی جهشها
- الگوریتمهای پیشبینی ساختار پروتئین (Protein Structure Prediction)
- الگوریتمهای شبکههای بیولوژیکی (Biological Networks) و مسیرهای سیگنالینگ
- الگوریتمهای یادگیری ماشین (Machine Learning) در پیشبینی پاسخ به دارو
- الگوریتمهای فارماکوژنومیک (Pharmacogenomics) برای پیشبینی عوارض دارویی
- پیادهسازی الگوریتمها با Python و R
کاربرد صنعتی: توسعه ابزارهای نرمافزاری برای شرکتهای داروسازی و تشخیصی.
آشنایی با ساخت دیتابیس های حجیم در تحلیل رابطه دارو با نتایج NGS
آموزش طراحی و مدیریت پایگاههای داده برای دادههای NGS:
- طراحی پایگاه داده رابطهای (Relational Database) برای دادههای NGS
- ایجاد جداول برای جهشها (Mutations)، بیان ژن (Gene Expression)، اطلاعات بالینی
- اتصال به پایگاههای داده عمومی: TCGA, COSMIC, DrugBank
- بهینهسازی پرسوجوها برای دادههای حجیم NGS
- مدیریت متادیتا (Metadata) و annotation نمونهها
- ایجاد Data Warehouse برای یکپارچهسازی دادههای چندمنبعه
کاربرد تحقیقاتی: پایهای برای مطالعات بزرگمقیاس در سرطان و پاسخ به درمان.
آموزش مقدماتی با برنامه نویسی زبان PHP در ساخت سازه های تحلیلی داروسازی ژنتیکی
آموزش برنامهنویسی PHP برای توسعه ابزارهای تحت وب در داروسازی:
- مبانی برنامهنویسی PHP و مفاهیم شیءگرایی
- ایجاد فرمهای تحت وب برای ورود دادههای بالینی و ژنتیکی
- پیادهسازی الگوریتمهای محاسباتی در PHP
- اتصال به پایگاه داده MySQL از طریق PHP
- ایجاد API برای سرویسدهی به اپلیکیشنهای دیگر
- امنیت در برنامهنویسی تحت وب برای دادههای حساس پزشکی
کاربرد صنعتی: توسعه پورتالهای تحت وب برای تحلیل دادههای ژنتیکی در بیمارستانها و شرکتهای دارویی.
آشنایی با نحوه ساخت سازه های بیوانفورماتیکی در انتخاب داروی مناسب سرطان از طریق نتایج NGS
آموزش توسعه سیستمهای پیشنهاددهنده دارو بر اساس پروفایل ژنتیکی:
- طراحی سیستم پیشنهاد دارو (Drug Recommendation System)
- یکپارچهسازی دادههای جهش، بیان ژن، و اطلاعات دارویی
- پیادهسازی الگوریتمهای تطابق (Matching Algorithms) برای پیشنهاد درمان
- استفاده از شبکههای تعامل پروتئین-دارو (Protein-Drug Interaction Networks)
- ایجاد امتیازدهی (Scoring System) برای اولویتبندی داروها
- اعتبارسنجی پیشنهادات با استفاده از دادههای بالینی موجود
کاربرد بالینی: کمک به پزشکان در انتخاب درمان شخصیشده برای بیماران سرطانی.
برنامه نویسی تحت سرور بر اساس پرشکی فرد محور و توابع تشخیص بیماری ها
آموزش توسعه سرویسهای سروری برای پزشکی فردمحور:
- ایجاد سرویسهای وب (Web Services) برای تحلیل دادههای ژنتیکی
- پیادهسازی توابع تشخیص بیماری (Disease Diagnosis Functions)
- توسعه الگوریتمهای ریسکسنجی (Risk Assessment Algorithms)
- ایجاد سیستمهای پشتیبانی تصمیم بالینی (Clinical Decision Support Systems)
- پیادهسازی پروفایلسازی بیمار (Patient Profiling)
- مدیریت جلسات کاربر (User Sessions) و امنیت دادهها
کاربرد صنعتی: توسعه سیستمهای نرمافزاری برای کلینیکها و مراکز درمانی.
آشنایی با توابع و ساختار های حلقه ای
آموزش مفاهیم پیشرفته برنامهنویسی برای پردازش دادههای زیستی:
- انواع حلقهها (Loops): for, while, foreach و کاربردهای آنها
- ساختارهای شرطی (Conditional Statements) پیشرفته
- پیادهسازی توابع بازگشتی (Recursive Functions)
- بهینهسازی کد برای پردازش دادههای حجیم NGS
- مدیریت حافظه (Memory Management) در پردازش دادههای بزرگ
- پیادهسازی الگوریتمهای بازگشتی برای مسائل بیوانفورماتیکی
کاربرد تحقیقاتی: پایهای برای توسعه الگوریتمهای پیچیده در پردازش دادههای ژنومی.
انتقال اطلاعات بین سرور و SQL
آموزش تکنیکهای پیشرفته ارتباط با پایگاه داده:
- اتصال به MySQL از طریق PHP با استفاده از PDO و MySQLi
- انجام عملیات CRUD (Create, Read, Update, Delete)
- پیادهسازی تراکنشها (Transactions) برای یکپارچگی دادهها
- بهینهسازی پرسوجوهای SQL برای دادههای حجیم
- ایجاد Stored Procedures و Functions در MySQL
- مدیریت اتصالهای همزمان (Concurrent Connections)
کاربرد صنعتی: توسعه سیستمهای اطلاعاتی برای مدیریت دادههای ژنومی و بالینی.
استفاده از توابع چندگانه در طراحی های کاربردی
آموزش توسعه ماژولار و استفاده از توابع پیشرفته:
- طراحی ماژولار (Modular Design) برای کدهای بیوانفورماتیکی
- ایجاد کتابخانههای توابع (Function Libraries) تخصصی
- پیادهسازی توابع آماری برای تحلیل دادههای ژنومی
- ایجاد توابع visualization برای نمایش نتایج
- توسعه پکیجهای نرمافزاری قابل استفاده مجدد
- مستندسازی کد و ایجاد API Documentation
کاربرد تحقیقاتی: توسعه ابزارهای نرمافزاری قابل استفاده توسط سایر پژوهشگران.
مدیریت و آنالیز داده های سرور
آموزش تکنیکهای مدیریت و تحلیل دادههای سروری:
- مدیریت فایلهای حجیم مانند فایلهای FASTQ و VCF
- پیادهسازی لاگگیری (Logging) و مانیتورینگ سیستم
- مدیریت خطاها (Error Handling) و استثناها
- ایجاد سیستمهای گزارشدهی (Reporting Systems) خودکار
- بهینهسازی کارایی (Performance Optimization) سرور
- مدیریت پشتیبانگیری (Backup) و بازیابی دادهها
کاربرد صنعتی: نگهداری و توسعه سیستمهای تولیدی در محیطهای بالینی.
تحلیل داده ها و خروجی گرفتن از آن
آموزش تکنیکهای نهایی تحلیل و گزارشدهی نتایج:
- تولید گزارشهای خودکار (Automated Reports) برای پزشکان
- خروجیگیری در فرمتهای مختلف: PDF, Excel, JSON
- ایجاد داشبوردهای تعاملی (Interactive Dashboards)
- پیادهسازی ویژوالایزیشنهای پیشرفته (Advanced Visualizations)
- تولید نتایج قابل تفسیر بالینی (Clinically Actionable Results)
- ایجاد سیستمهای هشدار (Alert Systems) برای یافتههای مهم
کاربرد بالینی: ارائه نتایج به صورت کاربرپسند و قابل استفاده برای تیم درمان.
آینده شغلی و بازار کار:
فرصتهای شغلی:
- بیوانفورماتیسین تخصصی سرطان در مراکز تحقیقاتی
- توسعهدهنده نرمافزارهای پزشکی فردمحور
- تحلیلگر دادههای ژنومیک در شرکتهای داروسازی
- متخصص بیوانفورماتیک در بیمارستانهای تخصصی سرطان
- مشاور فنی در پروژههای پزشکی فردمحور
مراکز هدف برای جذب فارغالتحصیلان:
- مراکز تحقیقات سرطان و انستیتوهای تخصصی
- شرکتهای داروسازی بینالمللی
- استارتآپهای فعال در حوزه پزشکی فردمحور
- بیمارستانهای دانشگاهی و مراکز جامع سرطان
- شرکتهای توسعه دهنده نرمافزارهای پزشکی
مزایای شرکت در این دوره:
- آموزش کاملاً پروژهمحور با دادههای واقعی NGS سرطان
- یادگیری برنامهنویسی کاربردی در حوزه پزشکی فردمحور
- آشنایی با آخرین تکنیکهای تحلیل دادههای ژنومیک
- توسعه مهارتهای مورد نیاز صنعت داروسازی مدرن
- آمادگی برای ورود به بازار کار پررونق بیوانفورماتیک سرطان
- دریافت گواهینامه معتبر مورد تأیید مراکز تحقیقاتی و صنعتی
سرفصل های دوره
قوانین و شرایط ثبت نام
محدودیتی در رشته و مقطع تحصیلی شرکت کننندگان وجود ندارد
امکان انصراف از ثبت نام و عودت وجه پرداختی تحت هیچ شرایط امکانپذیر نمی باشد
در برنامه های حضوری، تحت هیچ شرایط امکان آوردن فرد همراه به داخل مجتمع امکانپذیر نمی باشد
در برنامه های حضوری، همراه داشتن و استفاده از تلفن همراه در آزمایشگاه اکیدا ممنوع و در صورت مشاهده از ادامه حضور در آزمایشگاه ممانعت خواهد شد
جهت مشاهده تاریخ برگزاری دوره ها به ناحیه کاربری خود در سامانه مراجعه نمایید
شرکت در بزرگترین رویداد علوم سلولی تکوینی ایران
اولین کنگره بین المللی تکوین سلولی
